MySQL 4.1不向下相容，最主要的原因就是他在語系編碼的支援上大幅度的進步，但是剛裝起來的人一定都覺得奇怪，為什麼會跑出一堆亂碼，我昨天經過一整晚的折騰後，終於把問題解決了，最主要的原因是他預設的語言編碼是latin1。另外，這篇是以UTF-8編碼的資料為範例，Big5應該也可以，不過我沒測試過，想測試的人就把文章中一些編碼的參數改成Big5應該就可以了。還有我的環境是Windows XP。
既然這篇要講的是升級問題，當然有個步驟，首先在升級之前，備份的你的資料庫，這點很重要，當你即使照著我的方法還是失敗時，你還有一條退路，而且將資料輸出成sql檔案也是我的升級步驟一。備份資料的方法有三個，如果有裝phpMyadmin，可以直接用他的匯出功能輸出sql檔案，記得不要只輸出結構，資料也要輸出。另一個方法是用mysqldump，檔案在mysql安裝目錄的bin子目錄裡面，你必須進入指令列模式（DOS視窗）才可以正確的操作該程式，要備份所有的資料庫，你可以輸入mysqldump --all-databases > all_databases.sql，這樣會把所有的資料都輸出到all_databases.sql這個檔案，檔案位置應該就是在bin裡面，如果有另外指定就看你指定到哪了。如果只要複製其中幾個資料庫則是用mysqldump --databases db_name1 db_name2 > databases.sql這樣的指令，db_name的部分就看你要匯出哪些資料庫。第三個方法是直接把mysql下的data子目錄的檔案都備份下來，但是這樣並不會有後面需要用的sql檔案，如果你用這個方法備份資料庫，你還是需要用前面兩個方法的其中一個來取得sql檔案。
備份完資料庫，取得sql檔案後，最好先用文字編輯軟體打開他，確定有沒有亂碼，如果你原先的資料不是UTF-8的話，可以趁這個機會用其他程式把sql檔案轉成UTF-8，這個檔案的編碼就是你後面設定mysql要用的編碼了。
接下來就可以安裝MySQL 4.1了，這部分可以用他的安裝檔，或用他的免安裝版都可以，只要確定能執行就可以。安裝完之後，我們要來修改my.ini這個檔案，這個檔案有可能在windows目錄裡面，也可能在mysql目錄裡面，如果不存在的話，你就必須要自己建立一個。如果已經存在的話，用文字編輯軟體打開來應該可以看到一些設定，我們要加設定的地方有四個，分別是[mysql]、[mysqld]、[client]、[mysqldump]四個地方，都在裡面加入default-character-set = utf8這個設定，如果沒有的話，你可以簡單建立一個內容如下的my.ini檔案：
[mysqld]
default-character-set = utf8
[mysqldump]
default-character-set = utf8
[mysql]
default-character-set = utf8
[client]
default-character-set = utf8檔案是放到windows目錄下比較保險，我自己用無安裝版是要放到那才會讀到，雖然好像可以調整位置，但是我還沒測試成功。OK之後重新啟動mysql，如果是直接安裝升級的話可能會有資料已經存在了，不過選取出來看應該會是亂碼，這時候你可以先手動刪除，或是你用phpMyadmin輸出的sql檔會先把重複的資料庫刪除（有選項可以勾選），那你也可以不用理會它，再來就是最後一步了，把你匯出的sql檔放回去，我是用phpMyAdmin來做這件事，發法是先隨便選一個資料庫（新安裝的也有預建好的test資料庫可以選），然後選擇sql這個選項，下面的文字檔案的位置處把你的sql檔案上傳，編碼選正確，然後送出就可以了。另外還可以用mysqldump，指令：mysqldump db_name < database.sql，不過這個方式我沒測試過，而且看說明檔提供的範例指令，看起來都是還原單一資料庫，又或許db_name可以隨便給吧。
如果一切順利，現在還原的資料庫編碼就是正確的了，要確認最好的方法是用phpMyAdmin來檢視，因為他有支援MySQL 4.1的編碼功能，只要沒問題，用他來檢視資料就不會有亂碼。雖然資料沒問題，不過原來的程式還要做修改，MovableType算是很簡單的了，我在一個日本網站有看到詳細的說明和解決辦法，iandeth.: Movable Type + MySQL 4.1 を組み合わせると日本語が文字化けする不具合／障害の解決方法:，說明的很詳細，其中解決辦法的部分我想不會日文也可以看的懂，就不多做解釋了（第一個方法只是加一行、不過第二個方法是比較好的解決方法）。
寫了這麼多，基本上不建議貿然升級4.1啦，最後才講好像不好XD。